2003年“非典”疫情期間，國家啟動《全國危險廢物和醫療廢物處置設施建設規劃》，各省分別建設危險廢物處理中心項目。為爭取和承接該項目，經吉林市政府同意，2004年5月，吉林市環境保護投資有限責任公司成立，由原吉林市環境保護局主管，系吉林省首家環境保護投資公司。2017年6月，經吉林市政府決定，無償劃轉至吉林市城市建設控股集團有限公司，作為其全資子公司運營。

      2020年2月，為進一步推動環保產業發展和區域環境治理，經吉林市政府批準，吉林市環境保護投資有限責任公司無償劃轉至吉林市國有資產監督管理委員會，為國有全資企業。根據協議，市國資委委托市生態環境局負責對公司履行部分出資人職責，承擔相應的國有資產保值增值責任。

      2021年5月，經市國資委批準，吉林市環境保護投資有限責任公司更名為吉林市環境保護投資控股集團有限公司（以下簡稱環投集團）。環投集團注冊資本1.12億元，公司下設10個部室、4家子公司（3家全資子公司，1家合資子公司），主營包括環保工程、環保技術、環保技術咨詢在內的項目投資、建設、運營。

      環投集團堅決深入貫徹落實習近平生態文明思想，緊緊圍繞“改善生態環境質量”這一核心，積極謀劃包裝生態環境治理項目，爭取國家、省市等各項資金支持，大力實施生態環境保護工程建設，與生態環境部門形成“管治結合”，不斷解決生態環境問題，推動經濟社會高質量發展和生態環境高水平保護。